278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1440 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  32.93 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  33.54 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.99 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.72 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.18 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.57 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.08 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.59 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.64 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.64 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.64 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.09 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  25.29 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  23.11 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  25.86 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  23.11 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  24.71 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  24.71 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  24.71 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.3 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.82 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.21 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  24.57 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.82 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  30.29 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.61 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  26.09 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  29.22 
 
 		 410 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.32 
 
 		 442 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.82 
 
 		 378 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  25.4 
 
 		 265 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>