More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 
199 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4079  Phosphoglycerate mutase  52.02 
 
 
215 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0325691  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  49.24 
 
 
194 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.9 
 
 
213 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.76 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 
210 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 
208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  36.23 
 
 
210 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  37.27 
 
 
200 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  36.65 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  36.65 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
212 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
211 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
212 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
200 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
214 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
212 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
211 aa  104  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
213 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
228 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
201 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 
363 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.52 
 
 
440 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 
205 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  38.29 
 
 
253 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
213 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  36.53 
 
 
197 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
212 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
212 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 
207 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
212 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
209 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.52 
 
 
442 aa  98.2  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.38 
 
 
378 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 
378 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
370 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.87 
 
 
369 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.1 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.1 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.24 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.9 
 
 
442 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 
208 aa  94.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
200 aa  94.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 
209 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.08 
 
 
207 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.47 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
448 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
448 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
447 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  36.9 
 
 
203 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 
229 aa  91.7  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  39.87 
 
 
218 aa  91.7  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.14 
 
 
356 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 
192 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  43.4 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 
402 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>