More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1141 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  73.85 
 
 		 202 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  72.08 
 
 		 197 aa  290  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  61.42 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  62.83 
 
 		 197 aa  237  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  58.67 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  48.19 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  48.19 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  41.97 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 		 194 aa  140  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  45.96 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  40.84 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  39.9 
 
 		 217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  40.36 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  43.43 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  43.43 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  38.02 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  39.06 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  47 
 
 		 445 aa  81.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  39.47 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 447 aa  77.8  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  42.86 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  42.74 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.63 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10190  fructose-2,6-bisphosphatase  42.48 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.96 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.67 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  39.2 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.8 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  40.46 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.59 
 
 		 378 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  40.71 
 
 		 452 aa  71.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.76 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  39.17 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  46.36 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  27.75 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  27.75 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.25 
 
 		 444 aa  68.6  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.52 
 
 		 442 aa  68.2  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  27.87 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.81 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  37.12 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>