More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3691 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.07 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  31.91 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  29.28 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.31 
 
 		 444 aa  71.6  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  31.01 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.57 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 256 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.44 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.64 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38.35 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 452 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.66 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  30.13 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.14 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  32.28 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  32.28 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  32.28 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  28.09 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  31.01 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  30.32 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  30.41 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  31.25 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 447 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.26 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  32.29 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>