More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1144 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.24 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.28 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 411 aa  91.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  35.62 
 
 		 203 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 224 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1132  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 		 241 aa  88.6  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 243 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.89 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.89 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 222 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.75 
 
 		 356 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.54 
 
 		 222 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.63 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.63 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.01 
 
 		 369 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.31 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.65 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.67 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.16 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.32 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.23 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.79 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.72 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.59 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.84 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.71 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.32 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.57 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  31.82 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.38 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.3 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  32.47 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.38 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.38 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.97 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  31.65 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>