More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0209 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
218 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
222 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  44.44 
 
 
222 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 
213 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  42.31 
 
 
205 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
214 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
209 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 
200 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.87 
 
 
442 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
206 aa  101  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
370 aa  101  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
214 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
213 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
213 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
195 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 
237 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
214 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  44.63 
 
 
214 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.41 
 
 
442 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.73 
 
 
442 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.27 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.16 
 
 
442 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  42.33 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40.91 
 
 
547 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
459 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
445 aa  95.5  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 
211 aa  95.1  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 
241 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  47.93 
 
 
440 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 
389 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
230 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.05 
 
 
442 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
448 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  41.27 
 
 
214 aa  92  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.53 
 
 
442 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.94 
 
 
452 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  36.3 
 
 
448 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 
452 aa  92  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
208 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  42.24 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.16 
 
 
444 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
447 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.29 
 
 
442 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
201 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  43.22 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  34.86 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  33.55 
 
 
203 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 
443 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40 
 
 
378 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
447 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.05 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.12 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.05 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 
197 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.13 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  36.16 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  36.54 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.02 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.25 
 
 
207 aa  82  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
226 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.02 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  36.36 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.06 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  33.7 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>