More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0476 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 195 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  54.69 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  54.69 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  44.95 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  44.56 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  32.99 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.68 
 
 		 369 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.99 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 411 aa  79  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  25.96 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.17 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.36 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  27.03 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.82 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.54 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  31.25 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.99 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1904  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  27.6 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.86 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  31.29 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.26 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  28.77 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.09 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.76 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  32.56 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.55 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.11 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.76 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.31 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0124  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>