More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1904 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1904  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  46.5 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  41.95 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  39 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  37 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.43 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.93 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  31.89 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.72 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.17 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  31.1 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.17 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.17 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  32.74 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  34.24 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.72 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.72 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  31.37 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.12 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  32.14 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  29.38 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  25.65 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.72 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  32 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.96 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.69 
 
 		 442 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.05 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  25.27 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.22 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.69 
 
 		 442 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  33.54 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  30.97 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  30.26 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.94 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.78 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  30.32 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>