More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0371 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 224 aa  470  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  73.21 
 
 		 224 aa  344  6e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  53.15 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  52.88 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  39.91 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  37.83 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  38.1 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  34.51 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  34.96 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  34.76 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  31.07 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 260 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 255 aa  98.2  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  33.33 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  29.38 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  28.45 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.39 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.52 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  41.49 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  36.17 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  28.77 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  26.47 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  39 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  31.56 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  39 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  29.63 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  38.95 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  43.66 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  31.36 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  28.84 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  31.36 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.36 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  25.34 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  37.89 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  31.36 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.36 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.32 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  25.94 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  31.52 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  37.89 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  41.05 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  30.6 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  25.98 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.36 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  38.78 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  28.24 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>