More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0239 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 
217 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 
217 aa  153  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  41.18 
 
 
221 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  35.35 
 
 
216 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  34.26 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  35.43 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  37.97 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  34.96 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  36.65 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  35.35 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
255 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
234 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
234 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
234 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
253 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  31.71 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.49 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.69 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.57 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  25.57 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  40.22 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  42.11 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.73 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.72 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  29.19 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  38.46 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  29.59 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  40.57 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  40.57 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  27.94 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.61 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  38.61 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.65 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.61 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  39.6 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  29.78 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>