More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0116 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
221 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  58.37 
 
 
218 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
207 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
265 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  28.17 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
445 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  27.92 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.27 
 
 
442 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.78 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  31.32 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.35 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  30.28 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  30.28 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  30.28 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  32.37 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  26 
 
 
448 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.41 
 
 
547 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  25.5 
 
 
448 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  29.95 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  33.16 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  24.17 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.67 
 
 
442 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  32.64 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  28.27 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.33 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_006686  CND04610  hypothetical protein  29.58 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  28.44 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.35 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  30.61 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.13 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.12 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.12 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.35 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.67 
 
 
442 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  32.8 
 
 
224 aa  62.4  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  34.12 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 
459 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.13 
 
 
220 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  42 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>