More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1627 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  42.52 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  39.91 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  38.39 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  39.07 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  38.24 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  36.97 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  35.71 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  32.88 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  35.38 
 
 		 229 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  31.43 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 265 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  30.99 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  30.37 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  31.03 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  29.67 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  25.77 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  27.15 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  27.54 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  32.62 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.37 
 
 		 443 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  26.54 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  26.94 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  26.94 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.51 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.51 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.94 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  23.98 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  22.71 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  23.28 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>