More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1692 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 216 aa  454  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  39.91 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  39.07 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  38.64 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  39.91 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  37.61 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  34.74 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  35.82 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  32.88 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  30.7 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  25.84 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  27.72 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  26.9 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  28.31 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  29.94 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  29.19 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  29.44 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  26.21 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  25.12 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0981  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.632698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  37.25 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  26.03 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  30.39 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  26.83 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  29.83 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  29.83 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  29.83 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  31.55 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  27.09 
 
 		 601 aa  68.6  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  29.38 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  26.21 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  27.98 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.43 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  29.12 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  25.6 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.95 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  28.79 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  30.94 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  28.73 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  28.49 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0332  phosphoglycerate mutase 1  26.53 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000043605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  28.27 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  26.34 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  37.62 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  37.62 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  27.07 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  27.6 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>