More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2546 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  44.68 
 
 
265 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  43.81 
 
 
260 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  43.91 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  43.91 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  43.91 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  43.91 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  43.91 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  43.91 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  42.36 
 
 
237 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  42.36 
 
 
236 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
253 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  34.89 
 
 
234 aa  142  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  35.9 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 
230 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  36.16 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
235 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  35.98 
 
 
229 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
218 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  30.48 
 
 
221 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  34.66 
 
 
218 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  30.97 
 
 
231 aa  99  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  30.88 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  31.67 
 
 
216 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  33.51 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 
224 aa  97.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 
207 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
208 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 
191 aa  88.6  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
204 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 
203 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.22 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.22 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  27.93 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
186 aa  75.1  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.67 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  26.91 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  26.91 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  27.36 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  26.91 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  26.82 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  26.58 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  45.16 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  25.47 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  25.33 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 
192 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  29.3 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  26.69 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1132  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  24.06 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  24.67 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  29.41 
 
 
214 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
194 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
207 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  25.33 
 
 
220 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
221 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
221 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>