More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1132 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1132  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 241 aa  500  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  31.6 
 
 		 193 aa  88.6  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 199 aa  72  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  46.32 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  27.18 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.3 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  40.19 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  28.51 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  29.13 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  28.44 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30.47 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  29.67 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  25.86 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  27.97 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  27.97 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 189 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  28.24 
 
 		 203 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.36 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.16 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.53 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  38.18 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  38.68 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  25 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.5 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.16 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40.23 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  27.67 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  46 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.37 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  25.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.21 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  40.62 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  29.67 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  28.96 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.6 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  37.6 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  35.77 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  25.43 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>