More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2972 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 
247 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  85.77 
 
 
248 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  82.52 
 
 
246 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  79.18 
 
 
251 aa  380  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  74.9 
 
 
248 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  73.28 
 
 
248 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  74.03 
 
 
252 aa  363  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  73.68 
 
 
247 aa  358  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  76.11 
 
 
248 aa  358  5e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  74.69 
 
 
250 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  72.29 
 
 
249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  72.24 
 
 
248 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  72.47 
 
 
248 aa  354  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  71.43 
 
 
247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  72.13 
 
 
251 aa  351  5.9999999999999994e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  68 
 
 
251 aa  344  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  70.73 
 
 
248 aa  339  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  66.94 
 
 
246 aa  338  2.9999999999999998e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  75 
 
 
248 aa  338  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  67.35 
 
 
246 aa  337  8e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  71.26 
 
 
247 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  71.84 
 
 
247 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  71.02 
 
 
257 aa  330  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  71.84 
 
 
247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  68.22 
 
 
250 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  70.61 
 
 
258 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.37 
 
 
250 aa  322  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  67.54 
 
 
248 aa  321  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  67.54 
 
 
248 aa  321  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  69.39 
 
 
255 aa  321  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  67.54 
 
 
248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  65.84 
 
 
249 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  68.27 
 
 
250 aa  314  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  309  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  68.85 
 
 
278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  67.9 
 
 
248 aa  308  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  68.03 
 
 
333 aa  300  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  67.76 
 
 
245 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  63.45 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  55.34 
 
 
282 aa  275  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.02 
 
 
244 aa  265  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  54.69 
 
 
248 aa  263  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  54.25 
 
 
249 aa  259  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  51.81 
 
 
253 aa  259  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
306 aa  256  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.66 
 
 
237 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  51.82 
 
 
248 aa  255  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.47 
 
 
247 aa  254  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 
248 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  55.91 
 
 
247 aa  252  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  53.04 
 
 
248 aa  251  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 
270 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 
270 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  53.47 
 
 
249 aa  251  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 
248 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  53.1 
 
 
267 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  53.47 
 
 
247 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 
248 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 
251 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 
251 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 
250 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  55.3 
 
 
228 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 
247 aa  249  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 
249 aa  248  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 
247 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  54.5 
 
 
247 aa  248  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  54.3 
 
 
230 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  54.38 
 
 
229 aa  246  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  55.81 
 
 
228 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  51.81 
 
 
249 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  53.6 
 
 
247 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  52.49 
 
 
247 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  53.01 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  48.98 
 
 
247 aa  245  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 
253 aa  244  6.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  49.39 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  53.15 
 
 
293 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  54.05 
 
 
436 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  51.41 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  53.6 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.25 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  54.17 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  53.47 
 
 
247 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  53.85 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  51.43 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 
247 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  53.18 
 
 
247 aa  242  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  51 
 
 
250 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  52.25 
 
 
247 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 
247 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>