More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2210 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0124  phosphoglycerate mutase  37.64 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3230  phosphoglycerate mutase  40.69 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0540  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3235  Phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 224 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 226 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 212 aa  72  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.55 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.09 
 
 		 229 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.35 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.46 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.46 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.46 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  38.41 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  33.9 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.76 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  47.25 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  32.03 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.98 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1132  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  27.22 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  29.61 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  39.06 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.46 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>