More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0101 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  47.34 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  46.38 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  48.1 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  48.76 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  45.32 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  44.67 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  39.71 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  28.22 
 
 		 236 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 259 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 443 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.48 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 374 aa  84.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.22 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.28 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.28 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.28 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 421 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.07 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 445 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 241 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 448 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 452 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  24.53 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.3 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  24.53 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 459 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.58 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  35.26 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.76 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  31.6 
 
 		 584 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  31.71 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  31.71 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  31.71 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>