More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0124 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0124  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3230  phosphoglycerate mutase  42.7 
 
 
194 aa  147  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.64 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0540  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  32.75 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  29.51 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
405 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  32.24 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  28.71 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  30.63 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  29.65 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  29.65 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  29.65 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
208 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
223 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
221 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
221 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
240 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  31.89 
 
 
226 aa  61.6  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3235  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
213 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
207 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
190 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 
227 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
221 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  31.93 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  30.95 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.67 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  34.13 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  29.75 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  31.55 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  29.07 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  26.11 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  32.12 
 
 
210 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  30.38 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.95 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  30.59 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  30.07 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
391 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  29.07 
 
 
207 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
205 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  37.5 
 
 
197 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  30.23 
 
 
206 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.14 
 
 
222 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 
222 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.88 
 
 
200 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
194 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  29.11 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30 
 
 
382 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1132  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  30.72 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  31.33 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
293 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>