More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3570 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 		 211 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 		 206 aa  291  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  68.63 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  67.16 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 		 208 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 		 206 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 		 206 aa  287  7e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  65.07 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  67 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  66.18 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  69.31 
 
 		 207 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  67.16 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 207 aa  277  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  63.24 
 
 		 207 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  66.16 
 
 		 207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  63.86 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  64.22 
 
 		 212 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  59.8 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  59.31 
 
 		 206 aa  263  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  54.73 
 
 		 213 aa  234  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  57.64 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  49.33 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.91 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  51.4 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  55.32 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  50.66 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.91 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  48.26 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  47.16 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.89 
 
 		 249 aa  208  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  48 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  54.87 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  48.88 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  49.13 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  47.56 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  46.72 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  46.72 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  47.01 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  48.89 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  49.33 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  47.56 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  48.37 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  48.37 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  51.09 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  47.93 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  46.52 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  45.69 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  48.44 
 
 		 253 aa  197  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  47.91 
 
 		 249 aa  197  9e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  48.37 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  49.09 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  44.78 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  50 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>