More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3809 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  74.63 
 
 		 207 aa  330  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  76.5 
 
 		 207 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  72.68 
 
 		 208 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  72.68 
 
 		 208 aa  314  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  69.27 
 
 		 212 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  69.27 
 
 		 212 aa  304  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  69.27 
 
 		 212 aa  304  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  72 
 
 		 207 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 		 207 aa  297  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  69.46 
 
 		 207 aa  297  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  71 
 
 		 207 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 		 211 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 		 211 aa  291  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  67.32 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 		 211 aa  289  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  66.18 
 
 		 211 aa  285  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  67.32 
 
 		 206 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 		 206 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  67.16 
 
 		 206 aa  280  8.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  62.44 
 
 		 206 aa  274  8e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  64.39 
 
 		 206 aa  271  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  59.8 
 
 		 210 aa  265  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  55.94 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  48 
 
 		 248 aa  207  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.56 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 248 aa  204  7e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  49.07 
 
 		 247 aa  204  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  46.9 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  53.27 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  53.93 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.95 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  49.54 
 
 		 247 aa  201  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.93 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  51.31 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  48.65 
 
 		 229 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  47.71 
 
 		 253 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  54.26 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.89 
 
 		 250 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  48.36 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  46.98 
 
 		 293 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  48.2 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  51.23 
 
 		 225 aa  195  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  47.42 
 
 		 247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.69 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  46.19 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  46.98 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 436 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  48.36 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  47.22 
 
 		 247 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  44.44 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  46.48 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.81 
 
 		 227 aa  191  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.66 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  46.3 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  47.71 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  46.72 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  43.48 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 267 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  49.07 
 
 		 248 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  46.3 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  49.77 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  48.36 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  49.77 
 
 		 270 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  49.77 
 
 		 270 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 247 aa  188  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  48.61 
 
 		 248 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  44.83 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  44.89 
 
 		 228 aa  187  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  48.91 
 
 		 229 aa  187  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 248 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>