More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2593 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 		 227 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.91 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  46.67 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  45.79 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  40.97 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  46.64 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  46.64 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  45.29 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  43.11 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  46.19 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  44.05 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  43.24 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  42.67 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  42.67 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  39.04 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  39.92 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  39.92 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  37.4 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  44.89 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  42.04 
 
 		 206 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  38.65 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  41.05 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  37.15 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2961  phosphoglycerate mutase  39.82 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184565  normal  0.0787662 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  37.25 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  38.74 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  42.2 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  35.95 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  35.1 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  35.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  35.95 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  35.95 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  35.54 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  35.18 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  35.95 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  35.95 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  35.12 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  35.54 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  35.12 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  36.05 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  35.16 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  35.54 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  34.78 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  34.88 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  33.88 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  34.71 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  34.82 
 
 		 601 aa  156  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  35.57 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  34.71 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  37.5 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  35.59 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  35.54 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  34.68 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  36.36 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  34.4 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  41.86 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  35.08 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  36.03 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  33.88 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  35.34 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  33.88 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  33.88 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  36.33 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  41.86 
 
 		 212 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  38.43 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  35.12 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  36.76 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  35.54 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  33.88 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  34.82 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  36.4 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  37.71 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  33.2 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0981  phosphoglycerate mutase  35.46 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.632698 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  33.99 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>