More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1322 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  98.58 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  66.2 
 
 		 213 aa  276  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  58.64 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  56.25 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  57.22 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  58.12 
 
 		 207 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  56.19 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  60.21 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  60.73 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  59.69 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  55.91 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  56.7 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  57.29 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  55.73 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  55.73 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  56.54 
 
 		 207 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  57.07 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  57.07 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  57.07 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 		 207 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  53.93 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  53.4 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  53.65 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  43.24 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  44.59 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  51.55 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 		 250 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 		 250 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  50.55 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  44.08 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  44.08 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  41.48 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  41.89 
 
 		 250 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  41.07 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  42.29 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  44.08 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  43.78 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  42.34 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  51.08 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  41.89 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  42.34 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.5 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.19 
 
 		 248 aa  167  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  40.28 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  40.09 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  43.18 
 
 		 247 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.6 
 
 		 249 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  42.25 
 
 		 249 aa  164  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  40.09 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  42.34 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  41.85 
 
 		 247 aa  161  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  41.71 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  41.44 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  41.31 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  42.86 
 
 		 247 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  41.44 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  37.99 
 
 		 306 aa  159  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  43.36 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 248 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  41.28 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 		 293 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 270 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 270 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  43.19 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  41.89 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  41.78 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  42.65 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  41.78 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  42.33 
 
 		 270 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  42.72 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  43.38 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.85 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  41.28 
 
 		 248 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>