More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1612 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  77.73 
 
 		 247 aa  407  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  69.11 
 
 		 247 aa  357  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  68.7 
 
 		 247 aa  352  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 		 249 aa  342  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  67.48 
 
 		 251 aa  342  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 249 aa  340  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  65.45 
 
 		 249 aa  338  4e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  68.97 
 
 		 247 aa  337  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  65.71 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  69.57 
 
 		 247 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  68.1 
 
 		 247 aa  332  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.23 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  65.45 
 
 		 247 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  70 
 
 		 247 aa  329  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.67 
 
 		 250 aa  328  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  67.24 
 
 		 293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  69.57 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  67.07 
 
 		 436 aa  322  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  60.73 
 
 		 248 aa  322  5e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  64.2 
 
 		 250 aa  321  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  66.52 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  63.79 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  66.96 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  66.52 
 
 		 247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  68.26 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  66.81 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  67.39 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  61.73 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  61.73 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  57.09 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  61.73 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  61.32 
 
 		 250 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  61.32 
 
 		 250 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  61.73 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  61.73 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  61.73 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  66.52 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  66.52 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  61.32 
 
 		 250 aa  315  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  66.09 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  61.41 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  62.7 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  66.52 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  66.09 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  61.73 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  66.09 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  66.09 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  60.49 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  65.65 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  66.09 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  65.79 
 
 		 234 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  64.66 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  64.91 
 
 		 234 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  60.08 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  57.09 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  58.13 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  59.24 
 
 		 245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  60.68 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  61.11 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  60.68 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  58.78 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  63.6 
 
 		 229 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  59.83 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  59.83 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  60.26 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  59.83 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  59.83 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  59.83 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  59.4 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  63.32 
 
 		 247 aa  297  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  61.07 
 
 		 252 aa  297  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  58.13 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  65.35 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  55.74 
 
 		 601 aa  296  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 249 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>