More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5270 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 
207 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  55.17 
 
 
206 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 
208 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  54.68 
 
 
206 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
206 aa  204  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  53.69 
 
 
206 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  54.23 
 
 
207 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  56.22 
 
 
208 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  51.23 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  55.22 
 
 
211 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 
212 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  53.77 
 
 
207 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 
207 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 
212 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 
212 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  54.23 
 
 
211 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  52.74 
 
 
211 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  52.74 
 
 
211 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 
206 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 
207 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  52.22 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  49.74 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  52.13 
 
 
213 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  50 
 
 
210 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  51.55 
 
 
212 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  48.98 
 
 
201 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  51.03 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  47.89 
 
 
213 aa  169  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  41.1 
 
 
233 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  39.72 
 
 
249 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  37.85 
 
 
248 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  40.45 
 
 
247 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  39.72 
 
 
250 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  38.03 
 
 
226 aa  142  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  38.79 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  38.79 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  38.71 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  38.79 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  39.25 
 
 
250 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  37.85 
 
 
250 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  38.53 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  39.25 
 
 
228 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  36 
 
 
253 aa  138  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
237 aa  138  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  37.38 
 
 
235 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  37.38 
 
 
250 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  36.87 
 
 
248 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
248 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
220 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  39.25 
 
 
248 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  38.81 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  39.25 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  39.25 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  38.67 
 
 
249 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  38.71 
 
 
248 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  37.38 
 
 
250 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  40.09 
 
 
252 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  37.73 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  38.71 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  38.79 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  38.79 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
249 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  37.73 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  38.32 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  38.65 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  35.45 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  37.79 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  39.53 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  37.67 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 
253 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  38.14 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  37.79 
 
 
247 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  36.36 
 
 
228 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  34.08 
 
 
229 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  36.36 
 
 
228 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>