More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0291 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  55 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0332  phosphoglycerate mutase 1  55.8 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000043605 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  52.89 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  55.45 
 
 		 220 aa  237  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  50.67 
 
 		 230 aa  235  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  49.78 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  49.58 
 
 		 237 aa  228  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  48.29 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  47.86 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  47.86 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  48.67 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  48.73 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  49.12 
 
 		 229 aa  222  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  47.52 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  46.49 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  47.37 
 
 		 228 aa  218  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  47.37 
 
 		 228 aa  218  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  45.73 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  45.76 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  47.03 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  45.61 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  47.01 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  46.05 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  46.93 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.85 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.18 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  45.3 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  46.29 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  44.74 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  45.61 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  46.49 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  46.7 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  46.72 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  46.52 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  43.64 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  44.58 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  46.93 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  47.81 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  45.04 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  46.93 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  46.05 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  44.64 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  43.22 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  45.18 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  46.4 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  45.61 
 
 		 247 aa  204  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  43.86 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  45.18 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.74 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  46.05 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  43.83 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  41.74 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  46.49 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  44.74 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  46.49 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  45.61 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  42.74 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  44.26 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.3 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  42.37 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  45.18 
 
 		 248 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  46.49 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  46.49 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  46.49 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  44.74 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  44.87 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  46.05 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>