More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0332 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0332  phosphoglycerate mutase 1  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000043605 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  55.8 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  47.6 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  48.02 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  48.44 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  45.76 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  51.17 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  45.81 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  41.48 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  43.67 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  44.1 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  45.33 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  44.1 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  45.85 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  44.54 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  43.95 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  43.67 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  45.61 
 
 		 270 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  45.61 
 
 		 270 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  44.54 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  45.81 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  42.06 
 
 		 247 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  45.18 
 
 		 270 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  45.05 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  45.18 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  44.1 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  43.61 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.98 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  43.88 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  44.16 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  44.69 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  42.98 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  45.74 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  44.89 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  44.54 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  44.89 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  41.33 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  44 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  46.22 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  43.1 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  42.53 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  43.67 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.67 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  44.84 
 
 		 251 aa  188  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  44.29 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  41.13 
 
 		 333 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.23 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  45.41 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  43.67 
 
 		 247 aa  187  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  45.13 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  44.1 
 
 		 250 aa  187  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  43.67 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  44.1 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  42.73 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  42.41 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2498  phosphoglycerate mutase  43.18 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.956409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  45.89 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>