More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0672 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  99.19 
 
 
248 aa  500  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  89.18 
 
 
250 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  89.18 
 
 
250 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  81.22 
 
 
249 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  77.02 
 
 
249 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  76.95 
 
 
249 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  73.47 
 
 
248 aa  362  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  72.13 
 
 
248 aa  361  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  71.02 
 
 
251 aa  352  4e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  74.07 
 
 
247 aa  348  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  71.37 
 
 
248 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  68.98 
 
 
251 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  72.84 
 
 
250 aa  344  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  72.13 
 
 
248 aa  342  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  70.9 
 
 
251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  70.73 
 
 
248 aa  338  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  67.48 
 
 
248 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  67.83 
 
 
252 aa  328  4e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  69.96 
 
 
247 aa  328  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  69.55 
 
 
246 aa  327  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  64.9 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  66.94 
 
 
248 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  72.47 
 
 
248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  68.15 
 
 
250 aa  324  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  68.85 
 
 
258 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  67.36 
 
 
247 aa  323  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  69.11 
 
 
257 aa  322  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  68.03 
 
 
255 aa  321  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  65.84 
 
 
246 aa  316  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  64.08 
 
 
247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  67.47 
 
 
333 aa  305  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.79 
 
 
246 aa  305  6e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  62.35 
 
 
247 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  64.9 
 
 
248 aa  296  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  65.45 
 
 
278 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  60.25 
 
 
249 aa  292  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  65.45 
 
 
245 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  66.26 
 
 
252 aa  289  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  58.61 
 
 
247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  58.61 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  59.84 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  59.43 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  62.1 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  56.68 
 
 
253 aa  281  7.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  60.73 
 
 
247 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  60.27 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  60.27 
 
 
436 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  60.27 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  60.27 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  60.27 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  57.38 
 
 
248 aa  272  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  56.97 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  59.82 
 
 
248 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  55.74 
 
 
247 aa  271  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  59.82 
 
 
248 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 
270 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  54.03 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
251 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
251 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
267 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
248 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  57.99 
 
 
293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
248 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
250 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 
247 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  58.9 
 
 
247 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
248 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 
247 aa  264  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  53.25 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.53 
 
 
247 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
247 aa  262  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  57.53 
 
 
234 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  58.6 
 
 
228 aa  260  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.16 
 
 
250 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  57.99 
 
 
247 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.23 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  55.86 
 
 
247 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  57.99 
 
 
247 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  54.91 
 
 
250 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  53.69 
 
 
248 aa  256  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 
250 aa  254  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  54.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  55.45 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  53.69 
 
 
248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  57.53 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>