More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0713 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
247 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  77.73 
 
 
247 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  76.42 
 
 
247 aa  370  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  75.11 
 
 
247 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  76.86 
 
 
247 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  73.68 
 
 
247 aa  367  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  74.57 
 
 
250 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  75.98 
 
 
247 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  73.28 
 
 
293 aa  363  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  74.24 
 
 
247 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  73.25 
 
 
245 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  71.18 
 
 
267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  69.87 
 
 
248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  69.87 
 
 
251 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  69.87 
 
 
251 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  69 
 
 
436 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  69 
 
 
248 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  67.69 
 
 
248 aa  331  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  67.69 
 
 
270 aa  329  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  63.27 
 
 
247 aa  328  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  68.12 
 
 
250 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  67.69 
 
 
270 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  67.69 
 
 
270 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  67.69 
 
 
248 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  67.69 
 
 
270 aa  328  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  68.12 
 
 
248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  61.63 
 
 
247 aa  325  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  65.95 
 
 
248 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  66.38 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  65.52 
 
 
248 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 
247 aa  322  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  60 
 
 
247 aa  322  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  63.76 
 
 
247 aa  317  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  59.59 
 
 
249 aa  317  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  64.04 
 
 
229 aa  316  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  62.93 
 
 
247 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 
229 aa  311  5.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  59.02 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  61.48 
 
 
247 aa  304  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  61.14 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  57.96 
 
 
249 aa  300  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  59.39 
 
 
251 aa  299  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  57.33 
 
 
250 aa  295  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
250 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  57.33 
 
 
250 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.2 
 
 
248 aa  291  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  57.33 
 
 
250 aa  291  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 
249 aa  289  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  56.9 
 
 
250 aa  289  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  56.77 
 
 
245 aa  288  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
250 aa  288  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  59.21 
 
 
234 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 
245 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1395  phosphoglycerate mutase 1  57.58 
 
 
240 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0143791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
250 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  55.51 
 
 
248 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  56.03 
 
 
250 aa  285  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  55 
 
 
245 aa  284  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 
245 aa  284  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 
245 aa  284  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 
245 aa  284  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  55.46 
 
 
245 aa  284  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  53.47 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 
245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  57.69 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  56.77 
 
 
245 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 
245 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 
245 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  51.84 
 
 
248 aa  280  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  56.33 
 
 
240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  60.36 
 
 
247 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 
249 aa  278  8e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  51.43 
 
 
248 aa  276  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  59.38 
 
 
249 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  52.65 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  59.82 
 
 
249 aa  272  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>