More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6148 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  87.76 
 
 		 333 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  69.23 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  68.55 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  73.47 
 
 		 249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  70.2 
 
 		 251 aa  334  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  69.64 
 
 		 247 aa  328  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  70.33 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  70.45 
 
 		 247 aa  323  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  66.53 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  69.64 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  68.02 
 
 		 249 aa  319  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  71.84 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  69.23 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  71.84 
 
 		 258 aa  317  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  67.48 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  67.48 
 
 		 251 aa  316  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  70.61 
 
 		 255 aa  316  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  69.39 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  68.83 
 
 		 248 aa  307  9e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.83 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  67.83 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  67.83 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  60.98 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  67.39 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  72.24 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  70.73 
 
 		 278 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.39 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  65.22 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  65.31 
 
 		 248 aa  301  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  67.07 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  68.16 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  67.39 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  66.53 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  60.16 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  67.35 
 
 		 248 aa  297  9e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  60.98 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  56.45 
 
 		 248 aa  295  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  60.16 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  58.54 
 
 		 247 aa  294  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  60.16 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  61.84 
 
 		 247 aa  291  7e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  59.11 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  62.1 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  65.45 
 
 		 246 aa  289  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  62.28 
 
 		 248 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  62.72 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  63.01 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  57.66 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 248 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  61.4 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 247 aa  286  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  60.89 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.23 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.09 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  58.87 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  58.87 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  62.2 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  60.96 
 
 		 247 aa  284  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.57 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.41 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  59.76 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  58.87 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  60.53 
 
 		 248 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  61.21 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  59.68 
 
 		 436 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  58.77 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  65.31 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  60.98 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  59.35 
 
 		 293 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  58.94 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  57.49 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 		 249 aa  271  9e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  58.54 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  58.02 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  54.22 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  51.84 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  52.42 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  52.82 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  58.94 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.69 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  51.43 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  55.65 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>