More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70394 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  67.74 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  67.89 
 
 		 248 aa  335  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  67.61 
 
 		 247 aa  331  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  70.43 
 
 		 252 aa  328  7e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 		 251 aa  325  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 		 247 aa  321  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  68.31 
 
 		 247 aa  321  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  65.45 
 
 		 247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  69.55 
 
 		 251 aa  318  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  68.31 
 
 		 249 aa  317  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  64.9 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  67.89 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  68.16 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.2 
 
 		 258 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.2 
 
 		 255 aa  311  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  67.9 
 
 		 247 aa  308  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  65.84 
 
 		 248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  66.26 
 
 		 249 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  65.31 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  63.71 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  60.48 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  65.16 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  64.08 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  64.63 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  64.07 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  64.61 
 
 		 250 aa  294  9e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  63.48 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  63.48 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.35 
 
 		 250 aa  291  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.01 
 
 		 246 aa  291  9e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  63.91 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  62.96 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  64.23 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  63.41 
 
 		 246 aa  288  7e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  65.02 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  62.17 
 
 		 250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  62.86 
 
 		 248 aa  281  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  54.44 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  55.51 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  62.1 
 
 		 245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  64.2 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  55.74 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  54.03 
 
 		 248 aa  269  2e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  54.03 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  55.06 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  57.27 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  53.6 
 
 		 306 aa  268  5e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  55.79 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  55.65 
 
 		 436 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  55.02 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  54.84 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  56.9 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  58.08 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  58.08 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  53.42 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  58.08 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  57.92 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  57.64 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.63 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  56.45 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  53.41 
 
 		 249 aa  261  4.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  56.45 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 270 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  54.74 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>