More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0468 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 333 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  87.76 
 
 		 245 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  68.55 
 
 		 248 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  69.11 
 
 		 247 aa  335  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  69.39 
 
 		 251 aa  328  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  70.31 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  70.28 
 
 		 249 aa  322  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  71.72 
 
 		 255 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  68.02 
 
 		 247 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  68.02 
 
 		 249 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  68.7 
 
 		 247 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  67.48 
 
 		 248 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  68.95 
 
 		 278 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  69.11 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  70.9 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  69.51 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  64.49 
 
 		 248 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  68.85 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  65.85 
 
 		 251 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  71.88 
 
 		 248 aa  305  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  69.23 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  63.71 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  65.37 
 
 		 252 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  66.4 
 
 		 250 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 		 249 aa  301  7.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  67.09 
 
 		 248 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  67.09 
 
 		 248 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  68.03 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  56.85 
 
 		 248 aa  299  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  66.24 
 
 		 248 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  66.53 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  66.39 
 
 		 247 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  67.62 
 
 		 248 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  65.8 
 
 		 250 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  67.07 
 
 		 248 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  65.37 
 
 		 249 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 		 248 aa  291  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  58.47 
 
 		 249 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 247 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.06 
 
 		 248 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.94 
 
 		 250 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  58.3 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 247 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  62.04 
 
 		 246 aa  285  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.82 
 
 		 246 aa  285  8e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  60.09 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  60.96 
 
 		 247 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 		 247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  65.02 
 
 		 252 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  57.96 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  58.61 
 
 		 247 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 251 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  56.67 
 
 		 270 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  56.67 
 
 		 270 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  58.33 
 
 		 248 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  57.64 
 
 		 270 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 		 248 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  57.89 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  54.84 
 
 		 249 aa  272  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  57.02 
 
 		 436 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  58.33 
 
 		 248 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  57.89 
 
 		 248 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.02 
 
 		 250 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 		 248 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  58.33 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  58.77 
 
 		 247 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  53.63 
 
 		 248 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  57.44 
 
 		 246 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  57.33 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  55.02 
 
 		 234 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 228 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  55.65 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  55.65 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  51 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  56.14 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 249 aa  262  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  57.89 
 
 		 247 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 		 251 aa  262  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  54.08 
 
 		 234 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  56.77 
 
 		 247 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  56.77 
 
 		 232 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.26 
 
 		 247 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 		 247 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  52.65 
 
 		 229 aa  259  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  53.88 
 
 		 250 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 		 249 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  59.11 
 
 		 229 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>