More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8222 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  75.51 
 
 
248 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  75.41 
 
 
247 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  77.05 
 
 
258 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  76.98 
 
 
250 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  76.23 
 
 
255 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  75.2 
 
 
247 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  76.23 
 
 
247 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  72.06 
 
 
248 aa  363  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  73.79 
 
 
250 aa  361  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  70.8 
 
 
251 aa  360  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  75.51 
 
 
257 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  75.51 
 
 
247 aa  358  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  73.17 
 
 
251 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  72.95 
 
 
249 aa  351  5.9999999999999994e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  71.95 
 
 
248 aa  347  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  68.83 
 
 
248 aa  345  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  71.66 
 
 
248 aa  345  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  70.97 
 
 
248 aa  341  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  74.07 
 
 
278 aa  340  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  69.83 
 
 
252 aa  340  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  75 
 
 
252 aa  338  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  69.49 
 
 
250 aa  338  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  69.8 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  68 
 
 
247 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  74.18 
 
 
248 aa  332  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  68.83 
 
 
246 aa  330  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  69.57 
 
 
248 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  69.57 
 
 
248 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  68.7 
 
 
247 aa  328  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  68.98 
 
 
248 aa  327  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  69.13 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  70 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.83 
 
 
250 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  69.39 
 
 
333 aa  319  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  63.56 
 
 
246 aa  319  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  64.23 
 
 
248 aa  314  9e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  69.39 
 
 
245 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  61.94 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  57.89 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  58.13 
 
 
247 aa  284  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  54.66 
 
 
248 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  54.25 
 
 
248 aa  276  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 
248 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  58.3 
 
 
248 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  58.3 
 
 
270 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  58.3 
 
 
270 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  57.89 
 
 
248 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  57.21 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 
270 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 
248 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  55.78 
 
 
267 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 
247 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  56.68 
 
 
293 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.4 
 
 
436 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  56.18 
 
 
251 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  56.18 
 
 
251 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  54.47 
 
 
247 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  54.07 
 
 
247 aa  268  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 
250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  56.05 
 
 
247 aa  268  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 
248 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.87 
 
 
247 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.47 
 
 
248 aa  267  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  53.66 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  55.47 
 
 
248 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  56.05 
 
 
234 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  53.66 
 
 
249 aa  262  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  56.31 
 
 
247 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  51.82 
 
 
248 aa  261  6e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.36 
 
 
250 aa  261  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 
247 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  50.81 
 
 
248 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  56.25 
 
 
247 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  49.81 
 
 
282 aa  259  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  56.05 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 
249 aa  258  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  56.1 
 
 
249 aa  258  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
247 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  55.61 
 
 
234 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 
249 aa  256  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.58 
 
 
237 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
247 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  55.16 
 
 
247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  56.42 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  53.39 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  50.41 
 
 
253 aa  252  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>