More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0927 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  87.85 
 
 		 293 aa  434  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  85.83 
 
 		 247 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  84.62 
 
 		 247 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  83.4 
 
 		 247 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  83 
 
 		 247 aa  410  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  83.48 
 
 		 247 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  83.91 
 
 		 247 aa  407  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  76.11 
 
 		 247 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  74.9 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  74.09 
 
 		 267 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  70.45 
 
 		 247 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  74.49 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  73.09 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  73.09 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  73.09 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  73.68 
 
 		 270 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  72.47 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  74.09 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  73.68 
 
 		 248 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  73.68 
 
 		 270 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  73.09 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  73.68 
 
 		 270 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  73.09 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  72.47 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  73.09 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  73.09 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  74.49 
 
 		 270 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  74.14 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  75.55 
 
 		 247 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  72.87 
 
 		 248 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  72.87 
 
 		 248 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  67.61 
 
 		 247 aa  362  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  73.68 
 
 		 245 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  66.8 
 
 		 249 aa  355  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  65.59 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  69.83 
 
 		 247 aa  350  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  65.59 
 
 		 247 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  68.53 
 
 		 247 aa  346  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  64.92 
 
 		 251 aa  344  8e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  65.59 
 
 		 249 aa  343  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 247 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  64.08 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  61.13 
 
 		 248 aa  331  8e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 		 250 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  63.01 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 229 aa  329  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  62.75 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  63.27 
 
 		 250 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  63.27 
 
 		 250 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 		 250 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  63.27 
 
 		 250 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 		 250 aa  327  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 		 250 aa  327  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  66.23 
 
 		 229 aa  325  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 		 250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  63.32 
 
 		 245 aa  325  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 		 250 aa  325  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  63.01 
 
 		 248 aa  324  9e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  62.45 
 
 		 250 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 		 250 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  63.56 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  62.45 
 
 		 250 aa  321  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  62.88 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  62.88 
 
 		 245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  63.32 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  63.32 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  63.32 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  61.94 
 
 		 248 aa  318  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  62.88 
 
 		 245 aa  318  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  58.94 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  62.88 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  62.88 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  61.48 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  61.57 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 		 250 aa  315  6e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 		 250 aa  315  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 		 250 aa  315  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  56.91 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  57.49 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  56.1 
 
 		 248 aa  304  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  62.61 
 
 		 229 aa  304  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  60.96 
 
 		 234 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  60.68 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  60.26 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  59.34 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  55.33 
 
 		 247 aa  296  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  56.79 
 
 		 253 aa  296  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1395  phosphoglycerate mutase 1  57.74 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0143791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>