More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0382 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  87.34 
 
 
230 aa  411  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  83.84 
 
 
230 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  64 
 
 
229 aa  314  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  62.67 
 
 
230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  64.41 
 
 
228 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  63.72 
 
 
227 aa  297  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  60.17 
 
 
237 aa  285  5e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  59.21 
 
 
230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  58.15 
 
 
249 aa  278  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  57.89 
 
 
229 aa  276  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  60.26 
 
 
237 aa  275  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  57.89 
 
 
229 aa  275  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  57.27 
 
 
249 aa  275  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  61.95 
 
 
229 aa  274  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  55.79 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 
267 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 
247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  54.11 
 
 
228 aa  268  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  54.63 
 
 
247 aa  267  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  55.95 
 
 
249 aa  267  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  55.95 
 
 
249 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  57.64 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 
232 aa  265  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
247 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  55.9 
 
 
436 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  55.02 
 
 
248 aa  265  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  56.77 
 
 
247 aa  264  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.21 
 
 
247 aa  264  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  55.9 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  56.77 
 
 
293 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 
248 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  56.77 
 
 
247 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
228 aa  263  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
228 aa  263  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.22 
 
 
237 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.77 
 
 
250 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  56.77 
 
 
247 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  55.46 
 
 
247 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
251 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  52.36 
 
 
249 aa  261  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  53.45 
 
 
248 aa  261  6e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  55.02 
 
 
270 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  54.51 
 
 
248 aa  259  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  55.46 
 
 
248 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  55.9 
 
 
248 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  55.46 
 
 
270 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  55.46 
 
 
270 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  53.22 
 
 
247 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  55.02 
 
 
248 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  55.9 
 
 
247 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  54.59 
 
 
247 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  55.02 
 
 
247 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  55.02 
 
 
270 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  55.02 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  53.22 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 
228 aa  258  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  51.09 
 
 
601 aa  258  8e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
250 aa  257  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.71 
 
 
248 aa  257  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
250 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  51.93 
 
 
234 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
250 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  52.81 
 
 
228 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
250 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
250 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  54.15 
 
 
249 aa  256  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  54.59 
 
 
248 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  52.79 
 
 
234 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
250 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 
250 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
251 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
248 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2498  phosphoglycerate mutase  52.99 
 
 
243 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.956409  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
250 aa  254  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  53.25 
 
 
228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  53.71 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 
250 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  53.22 
 
 
248 aa  252  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  52.4 
 
 
247 aa  251  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  53.71 
 
 
245 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 
250 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>