More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3265 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  81.58 
 
 		 228 aa  371  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  73.68 
 
 		 228 aa  348  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  62.67 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  58.7 
 
 		 230 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  60 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  57.58 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  57.58 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 267 aa  278  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  58.01 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  59.57 
 
 		 247 aa  276  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  57.58 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  59.28 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  61.11 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 270 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  55.84 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 248 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  55.65 
 
 		 247 aa  267  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  56.71 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  56.71 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.28 
 
 		 436 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.19 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  57.83 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 333 aa  264  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  59.26 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  57.92 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  54.98 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2498  phosphoglycerate mutase  58.9 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.956409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  59.07 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  57.39 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  55.26 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  55.26 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 		 249 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.52 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  55.22 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  58.6 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  58.6 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  58.6 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  56.09 
 
 		 247 aa  258  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  58.9 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  56.58 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  54.78 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  52.81 
 
 		 233 aa  257  9e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  56.09 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  53.25 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  57.21 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.87 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  52.42 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  56.56 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  57.27 
 
 		 247 aa  254  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  57.41 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  55.31 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  56.36 
 
 		 228 aa  254  9e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  55.7 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  55.22 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  53.91 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  54.35 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  56.42 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  53.48 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  58.8 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  56 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.35 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  54.35 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  55.02 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  54.15 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>