More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0360 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  80.98 
 
 
207 aa  349  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  77.56 
 
 
207 aa  340  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  74.4 
 
 
207 aa  329  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  73.43 
 
 
207 aa  325  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  71.92 
 
 
207 aa  307  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  72.55 
 
 
206 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  71.57 
 
 
206 aa  301  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  72.06 
 
 
206 aa  300  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  69.46 
 
 
206 aa  297  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  72.08 
 
 
211 aa  296  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  69.5 
 
 
208 aa  291  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 
211 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  69.5 
 
 
208 aa  288  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  69 
 
 
211 aa  287  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  67.5 
 
 
212 aa  287  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  67.5 
 
 
212 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  67.5 
 
 
212 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  68 
 
 
211 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  66.5 
 
 
206 aa  277  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  66 
 
 
212 aa  275  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  63.86 
 
 
210 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  67 
 
 
206 aa  266  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  58.38 
 
 
201 aa  224  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  51.69 
 
 
213 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  49.55 
 
 
228 aa  217  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  49.55 
 
 
228 aa  217  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  54.97 
 
 
213 aa  207  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  50 
 
 
248 aa  206  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  47.56 
 
 
247 aa  206  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  48.2 
 
 
228 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  48.61 
 
 
248 aa  206  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48 
 
 
249 aa  203  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  46.4 
 
 
229 aa  203  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  46.12 
 
 
237 aa  201  6e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.4 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 
230 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  55.32 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  53.4 
 
 
212 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  48.36 
 
 
228 aa  197  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 
228 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  46.4 
 
 
227 aa  194  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 
248 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  53.77 
 
 
225 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 
253 aa  192  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 
247 aa  191  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  48.17 
 
 
247 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  45.37 
 
 
229 aa  191  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  45.33 
 
 
248 aa  191  9e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.95 
 
 
248 aa  190  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  47.22 
 
 
247 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  43.95 
 
 
253 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  48.02 
 
 
249 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 
230 aa  189  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  46.51 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.01 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
245 aa  188  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 
232 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  45.54 
 
 
249 aa  188  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  44.6 
 
 
245 aa  188  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.25 
 
 
227 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  44.6 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  44.6 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  44.13 
 
 
245 aa  187  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
245 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 
247 aa  187  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
245 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  45.83 
 
 
247 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.95 
 
 
235 aa  186  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
245 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
245 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
233 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  44.6 
 
 
245 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
250 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  50.22 
 
 
229 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 
247 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  45.28 
 
 
226 aa  185  3e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
249 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  48.4 
 
 
228 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  46.33 
 
 
250 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 
250 aa  184  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  43.64 
 
 
237 aa  184  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  47.71 
 
 
247 aa  184  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.13 
 
 
237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  45.54 
 
 
247 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  45.87 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  46.01 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
247 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  44.44 
 
 
234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>