More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2250 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  56.92 
 
 
204 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  55.12 
 
 
207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  55.67 
 
 
207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  51.23 
 
 
207 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  53.06 
 
 
201 aa  209  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  54.87 
 
 
210 aa  207  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  54.23 
 
 
207 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  54.97 
 
 
207 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  54.73 
 
 
207 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.84 
 
 
249 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  51.24 
 
 
212 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  51.24 
 
 
212 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  53.68 
 
 
211 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  50.75 
 
 
212 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  53.16 
 
 
211 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  51.31 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  53.68 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  54.74 
 
 
206 aa  199  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  46.02 
 
 
229 aa  197  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  44.78 
 
 
253 aa  194  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
212 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
206 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  50.25 
 
 
208 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
247 aa  192  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  45.26 
 
 
249 aa  193  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  50.25 
 
 
208 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
228 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  43.35 
 
 
234 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  51.05 
 
 
211 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 
249 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 
240 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  44.89 
 
 
249 aa  188  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  52.11 
 
 
206 aa  187  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  44.09 
 
 
247 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
253 aa  187  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  44.09 
 
 
247 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  43.18 
 
 
247 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  51.58 
 
 
206 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 
232 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  45.45 
 
 
247 aa  185  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 
250 aa  185  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  43.18 
 
 
247 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.09 
 
 
247 aa  185  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  44.09 
 
 
247 aa  185  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
253 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  44.09 
 
 
234 aa  184  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 
249 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 
250 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
251 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  45.69 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.24 
 
 
227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  42.54 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  42.79 
 
 
245 aa  182  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 
230 aa  182  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
251 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  47.4 
 
 
213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  45.62 
 
 
306 aa  181  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.45 
 
 
248 aa  181  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  44.09 
 
 
229 aa  181  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  43.04 
 
 
248 aa  181  7e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  42.27 
 
 
250 aa  181  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  44.7 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  44.7 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  44.7 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  44.7 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  44.7 
 
 
250 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  43.18 
 
 
247 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  43.1 
 
 
250 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  45.16 
 
 
250 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  43.18 
 
 
248 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.13 
 
 
212 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  44.7 
 
 
250 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  44.24 
 
 
250 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  48.39 
 
 
212 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  43.18 
 
 
436 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  45.12 
 
 
248 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  42.22 
 
 
237 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  45.16 
 
 
250 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  45.12 
 
 
248 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  42.27 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  43.18 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  43.78 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>