More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2434 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  98.11 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  98.11 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  80.68 
 
 		 208 aa  337  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  79.81 
 
 		 208 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  76.08 
 
 		 212 aa  327  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  69.61 
 
 		 211 aa  308  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  73 
 
 		 207 aa  307  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  70.1 
 
 		 207 aa  305  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  70.1 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  69.27 
 
 		 206 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  69.61 
 
 		 206 aa  298  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  68.29 
 
 		 206 aa  296  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  69.12 
 
 		 206 aa  296  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 		 207 aa  293  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 		 211 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  67.5 
 
 		 207 aa  287  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  68.5 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  68 
 
 		 207 aa  284  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  66.18 
 
 		 210 aa  281  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  64.88 
 
 		 206 aa  278  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  60.29 
 
 		 206 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  56.65 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  57.59 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.07 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  52.29 
 
 		 247 aa  204  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  54.79 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 		 213 aa  201  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48 
 
 		 249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  49.54 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50.23 
 
 		 248 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  49.54 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  52.26 
 
 		 201 aa  197  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  49.54 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  47.22 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.15 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  47.22 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  53.23 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  50.92 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  48.17 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  46.02 
 
 		 229 aa  191  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  47.22 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  46.51 
 
 		 293 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  46.95 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.48 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 		 250 aa  187  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.49 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  44.89 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  45.41 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  46.58 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 		 250 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  47.42 
 
 		 249 aa  184  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  46.01 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  46.33 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  46.01 
 
 		 250 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.3 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  46.05 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  44.89 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 248 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  44.59 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>