More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1152 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  57.64 
 
 		 210 aa  228  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  57.71 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  58.38 
 
 		 207 aa  224  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  58.88 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  57.29 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 206 aa  218  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 206 aa  218  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  57.36 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  57.87 
 
 		 207 aa  217  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  58.29 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  57.36 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  55.78 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 206 aa  214  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50.92 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  53.06 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  53.77 
 
 		 212 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.67 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  53.27 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  49.33 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  53.3 
 
 		 213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  46.32 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  48.89 
 
 		 228 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  48.89 
 
 		 228 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 		 212 aa  197  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  46.9 
 
 		 230 aa  195  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  51.81 
 
 		 204 aa  194  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  47.35 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  45.58 
 
 		 248 aa  192  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  43.98 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  48.61 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 		 232 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 248 aa  188  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 		 248 aa  187  8e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  45.5 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  45.98 
 
 		 249 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  47.22 
 
 		 228 aa  185  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  47.03 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  45.66 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  47.69 
 
 		 247 aa  184  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  45.37 
 
 		 306 aa  184  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 		 233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  45.66 
 
 		 247 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  45.58 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  47.47 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.76 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 245 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  45.62 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 248 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 270 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  43.84 
 
 		 248 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  45.66 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 270 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  46.08 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 		 270 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  43.84 
 
 		 247 aa  179  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 270 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  45.16 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  43.69 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  44.29 
 
 		 247 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  43.69 
 
 		 601 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  43.38 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  43.5 
 
 		 333 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  45.62 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.19 
 
 		 245 aa  178  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  45.21 
 
 		 247 aa  178  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  43.84 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1395  phosphoglycerate mutase 1  45.12 
 
 		 240 aa  177  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0143791  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1523  phosphoglycerate mutase 1 family  44.89 
 
 		 247 aa  177  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  45.21 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  43.84 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  44.29 
 
 		 436 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  45.95 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>