More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0394 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 		 246 aa  505  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  91.06 
 
 		 246 aa  441  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  65.32 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  68.29 
 
 		 246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  66.94 
 
 		 247 aa  337  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  66.94 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  66.94 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  65.52 
 
 		 252 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  67.61 
 
 		 247 aa  331  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  66.53 
 
 		 248 aa  331  8e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  63.01 
 
 		 251 aa  329  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  67.9 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  64.9 
 
 		 251 aa  325  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  65.18 
 
 		 247 aa  325  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  61.94 
 
 		 251 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  65.32 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  66.67 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  61.63 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  66.13 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  61.89 
 
 		 247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 		 250 aa  311  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.11 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  65.49 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  61.21 
 
 		 250 aa  301  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  62.8 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  61.63 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  62.28 
 
 		 248 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  62.28 
 
 		 248 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  62.07 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  60.25 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  62.3 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  62.72 
 
 		 248 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  60.94 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  60.82 
 
 		 257 aa  292  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  61.32 
 
 		 278 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  63.01 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  60.82 
 
 		 333 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 249 aa  274  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  60.25 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  53.85 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  54.25 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  54.22 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  57.66 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  57.66 
 
 		 250 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  57.66 
 
 		 250 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  60 
 
 		 245 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  54.07 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 		 270 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  55.86 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  54.71 
 
 		 436 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 270 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  53.85 
 
 		 248 aa  264  8.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  56.22 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  53.44 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 		 250 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  54.66 
 
 		 293 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  55.66 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  54.05 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  54.07 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  53.81 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>