More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0084 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  92.34 
 
 
250 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  89.18 
 
 
248 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  89.18 
 
 
248 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  89.18 
 
 
248 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  80.43 
 
 
249 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  78.54 
 
 
249 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  73.39 
 
 
249 aa  362  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  72.47 
 
 
248 aa  362  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  70.85 
 
 
248 aa  358  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  70.61 
 
 
251 aa  353  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  73.25 
 
 
250 aa  348  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  72.06 
 
 
248 aa  348  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  72.18 
 
 
248 aa  345  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  70.04 
 
 
251 aa  339  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  66.14 
 
 
251 aa  338  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  67.8 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  70.61 
 
 
247 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  70.33 
 
 
248 aa  335  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  69.88 
 
 
250 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  67.21 
 
 
248 aa  329  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  65.59 
 
 
248 aa  327  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  67.2 
 
 
247 aa  324  9e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
247 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  68.16 
 
 
247 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  65.59 
 
 
246 aa  321  9.000000000000001e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.35 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  67.34 
 
 
246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  66.94 
 
 
255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  67.61 
 
 
257 aa  318  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  69.87 
 
 
248 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  65.31 
 
 
247 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.16 
 
 
246 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  64.37 
 
 
247 aa  305  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  65.34 
 
 
333 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 
245 aa  293  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  64.63 
 
 
278 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  65.84 
 
 
252 aa  290  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  58.61 
 
 
249 aa  287  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  64.08 
 
 
248 aa  286  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  57.79 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  58.61 
 
 
247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  61.82 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
253 aa  282  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  59.43 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
270 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
270 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
248 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  58.61 
 
 
247 aa  280  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
270 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  62.73 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 
270 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  59.02 
 
 
247 aa  277  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  62.73 
 
 
436 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 
248 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  60.45 
 
 
247 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  62.27 
 
 
248 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  61.36 
 
 
248 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  59.55 
 
 
250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  61.36 
 
 
250 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
267 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  60.45 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  59.55 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  56.15 
 
 
249 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  55.33 
 
 
247 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  59.55 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  60.45 
 
 
247 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  59.09 
 
 
247 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 
293 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  54.47 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  59.55 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  59.09 
 
 
247 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  54.92 
 
 
248 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.18 
 
 
247 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  59.09 
 
 
247 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 
250 aa  261  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 
247 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.03 
 
 
249 aa  260  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 
251 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  53.44 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  56.36 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  258  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
250 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>