More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0994 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  77.59 
 
 		 250 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  73.36 
 
 		 248 aa  367  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  75.1 
 
 		 249 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  77.59 
 
 		 250 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  76.21 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  72.22 
 
 		 249 aa  362  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  74.59 
 
 		 248 aa  350  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  70.12 
 
 		 251 aa  348  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  69.8 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  72.13 
 
 		 250 aa  346  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  68.42 
 
 		 248 aa  344  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  69.39 
 
 		 248 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  71.54 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  71.49 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  70.49 
 
 		 247 aa  339  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  70.73 
 
 		 255 aa  338  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  70.49 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  69.96 
 
 		 246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  71.84 
 
 		 248 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  68.31 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  71.77 
 
 		 248 aa  325  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  68.03 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  66.4 
 
 		 257 aa  322  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  66.52 
 
 		 252 aa  322  4e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  66.67 
 
 		 246 aa  321  8e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  65.02 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  65.84 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  68.02 
 
 		 333 aa  314  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  65.04 
 
 		 247 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  64.9 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  66.26 
 
 		 248 aa  305  7e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  67.61 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  65.85 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  64.75 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  62.44 
 
 		 436 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  62.27 
 
 		 270 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  62.27 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  62.27 
 
 		 270 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  58.13 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  60.91 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  60.32 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  57.14 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  61.54 
 
 		 270 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  60.32 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  62.27 
 
 		 293 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  59.51 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  61.36 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  57.49 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  61.36 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  60.18 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  56.68 
 
 		 249 aa  275  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  58.82 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  57.09 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  60.45 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  58.7 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  59.82 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  60.45 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  60 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  54.25 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  59.09 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  55.06 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  58.18 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.44 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.34 
 
 		 245 aa  258  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  53.04 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.97 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  54.3 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  52 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  55.56 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  57.01 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  55.56 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  55.56 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.07 
 
 		 237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  55.56 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  55.56 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>