More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1210 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  64.44 
 
 
228 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  64.89 
 
 
228 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  62.67 
 
 
228 aa  291  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2498  phosphoglycerate mutase  60 
 
 
243 aa  284  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.956409  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 
248 aa  274  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  59.65 
 
 
249 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  61.33 
 
 
249 aa  268  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  57.89 
 
 
267 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  56.22 
 
 
233 aa  263  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
230 aa  263  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 
230 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  260  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
251 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
251 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  57.89 
 
 
247 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.46 
 
 
250 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  55.7 
 
 
248 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  56.14 
 
 
247 aa  258  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  55.95 
 
 
247 aa  258  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  56.58 
 
 
252 aa  258  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 
230 aa  258  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  56.58 
 
 
247 aa  256  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.58 
 
 
436 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  56.14 
 
 
247 aa  256  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  56.58 
 
 
293 aa  255  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
247 aa  255  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
251 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  56.83 
 
 
248 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  54.87 
 
 
229 aa  255  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  56.78 
 
 
248 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
248 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  54.67 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  55.11 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  56.14 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  55.07 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  55.7 
 
 
247 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  54.82 
 
 
247 aa  252  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.67 
 
 
246 aa  252  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  56.39 
 
 
248 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
249 aa  251  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  56.39 
 
 
248 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.83 
 
 
250 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  55.7 
 
 
253 aa  251  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
250 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 
333 aa  251  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  53.91 
 
 
248 aa  250  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  55.22 
 
 
247 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  56.14 
 
 
248 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  56.14 
 
 
270 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  53.51 
 
 
248 aa  249  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  56.14 
 
 
270 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  56.03 
 
 
249 aa  249  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 
248 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 
247 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  55.75 
 
 
246 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 
251 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  54.66 
 
 
237 aa  248  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  55.7 
 
 
248 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  51.09 
 
 
230 aa  248  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 
249 aa  248  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  54.13 
 
 
247 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  55.7 
 
 
270 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 
247 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  55.56 
 
 
248 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 
248 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  52.79 
 
 
234 aa  248  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 
247 aa  247  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 
248 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 
247 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  53.07 
 
 
250 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  53.07 
 
 
250 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  52 
 
 
229 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  53.75 
 
 
249 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
247 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  54.98 
 
 
247 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  53.07 
 
 
250 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  53.07 
 
 
250 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  53.19 
 
 
251 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  53.07 
 
 
250 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 
248 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  54.39 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 
270 aa  244  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>