More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4520 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  57.58 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  57.81 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  53.75 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  53.22 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  57.69 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  60.17 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  55.79 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  53.25 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  55.13 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  53.22 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  54.08 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  53.68 
 
 		 249 aa  255  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  49.79 
 
 		 246 aa  254  9e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  54.85 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  54.94 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  54.94 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50.87 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  53.25 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.54 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  54.94 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.12 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.03 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  52.99 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  52.99 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  53.39 
 
 		 249 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  54.94 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  51.65 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  52.14 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.62 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  56.9 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  55.17 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  55.6 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  49.13 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  54.67 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  53.25 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  54.55 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  48.92 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  45.21 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  44.84 
 
 		 249 aa  197  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  41.1 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.3 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  43.84 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2498  phosphoglycerate mutase  45.61 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.956409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  45.61 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  43.38 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  42.22 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.44 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  41.78 
 
 		 247 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  41.78 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  43.11 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  42.67 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  40.83 
 
 		 237 aa  188  9e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  39.82 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  42.86 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  42.86 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  44.59 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  42.92 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  41.33 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  41.78 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  41.33 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  42.47 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  43.36 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  41.33 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  41.1 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  40.44 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  40.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  44.75 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  41.78 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  42.22 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  41.33 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  40.18 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  42.4 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  39.56 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>