More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4931 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  70.45 
 
 
248 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  72.87 
 
 
247 aa  353  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  70.9 
 
 
251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  72.54 
 
 
249 aa  352  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  73.9 
 
 
251 aa  348  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  72.65 
 
 
250 aa  346  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  72.06 
 
 
248 aa  345  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  70.04 
 
 
248 aa  344  7e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  68.7 
 
 
251 aa  342  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  72.18 
 
 
246 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  70.26 
 
 
252 aa  342  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  71.02 
 
 
258 aa  340  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  68.16 
 
 
247 aa  339  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  71.26 
 
 
248 aa  339  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  71.26 
 
 
247 aa  337  8e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  70.49 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  68.02 
 
 
246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  75 
 
 
248 aa  335  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  69.8 
 
 
255 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.61 
 
 
246 aa  333  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  66.94 
 
 
248 aa  332  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  70.04 
 
 
248 aa  332  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  70 
 
 
248 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  70 
 
 
248 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  70 
 
 
248 aa  324  9e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  68.98 
 
 
247 aa  322  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  68.1 
 
 
250 aa  321  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  67.67 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  68.53 
 
 
250 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  67.35 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  65.86 
 
 
250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  68.02 
 
 
248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  65.71 
 
 
257 aa  304  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  68.03 
 
 
278 aa  301  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  66.39 
 
 
333 aa  298  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  65.98 
 
 
252 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  62.96 
 
 
248 aa  289  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  65.31 
 
 
245 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  54.29 
 
 
248 aa  263  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.36 
 
 
244 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  54.25 
 
 
249 aa  256  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  56.56 
 
 
247 aa  256  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 
247 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  54.32 
 
 
247 aa  248  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  50.98 
 
 
282 aa  248  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 
247 aa  247  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  52.24 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  51.82 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  53.81 
 
 
436 aa  244  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  51.84 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  50.61 
 
 
248 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
248 aa  241  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
247 aa  241  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  51.84 
 
 
251 aa  241  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  49.19 
 
 
253 aa  241  7.999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  52.7 
 
 
247 aa  240  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 
247 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  53.36 
 
 
293 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  51.64 
 
 
247 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  52.89 
 
 
267 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
248 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.68 
 
 
250 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  53.81 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  48.83 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  53.65 
 
 
250 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  53.81 
 
 
270 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  53.81 
 
 
270 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  49.59 
 
 
248 aa  238  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
270 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  51.01 
 
 
248 aa  238  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
270 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  52.02 
 
 
248 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  51.61 
 
 
249 aa  235  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.24 
 
 
249 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  52.02 
 
 
248 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 
251 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 
251 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  48.57 
 
 
247 aa  234  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 
248 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  52.05 
 
 
247 aa  234  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  48.58 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.23 
 
 
247 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  52.49 
 
 
250 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  52.02 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
250 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
249 aa  229  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  51.12 
 
 
247 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  51.13 
 
 
250 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>