More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  81.71 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  74.09 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  77.05 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  74.49 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  77.46 
 
 		 247 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  73.66 
 
 		 251 aa  371  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  75.1 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  76.17 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  75 
 
 		 248 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  75.41 
 
 		 251 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  76.96 
 
 		 248 aa  363  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  76.96 
 
 		 248 aa  363  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  72.95 
 
 		 251 aa  362  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  76.96 
 
 		 248 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  73.88 
 
 		 246 aa  361  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  73.62 
 
 		 250 aa  360  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  74.9 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  73.48 
 
 		 252 aa  358  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  75.3 
 
 		 258 aa  358  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  73.77 
 
 		 248 aa  358  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  72.29 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  74.9 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  72.76 
 
 		 257 aa  354  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  72.54 
 
 		 247 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  69.64 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  73.36 
 
 		 248 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  73.19 
 
 		 249 aa  347  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  71.6 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  71.31 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  73.28 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  70.85 
 
 		 247 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  69.64 
 
 		 247 aa  340  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.9 
 
 		 246 aa  330  9e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  70.28 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  68.31 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  69.51 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  73.47 
 
 		 245 aa  313  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  70.73 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  56.85 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  59.18 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  59.18 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  60 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.3 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  62.56 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  62.56 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  62.56 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  62.1 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  59.38 
 
 		 247 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  61.19 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  61.64 
 
 		 270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.8 
 
 		 237 aa  272  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 248 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  58.78 
 
 		 248 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.8 
 
 		 436 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  59.01 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  59.91 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.9 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  56.33 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.45 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  56.1 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  57.21 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  53.75 
 
 		 306 aa  262  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  57.53 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.65 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  58.45 
 
 		 253 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  54.03 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  57.85 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  54.29 
 
 		 248 aa  258  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  57.08 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  56.16 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  57.41 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  51.63 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  48.79 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  57.6 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>