More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1779 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  100 
 
 
246 aa  503  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  91.06 
 
 
246 aa  441  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  66.53 
 
 
248 aa  350  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  71.6 
 
 
249 aa  345  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  67.35 
 
 
248 aa  338  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  67.35 
 
 
247 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  67.34 
 
 
248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  69.96 
 
 
249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  68.02 
 
 
247 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  66.94 
 
 
248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  67.48 
 
 
246 aa  333  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  63.82 
 
 
251 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  63.56 
 
 
251 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  67.74 
 
 
248 aa  329  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  65.52 
 
 
252 aa  327  7e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  65.59 
 
 
247 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  65.32 
 
 
248 aa  322  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  64.08 
 
 
251 aa  319  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  62.45 
 
 
248 aa  319  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.79 
 
 
250 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.66 
 
 
250 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  61.89 
 
 
247 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  64.47 
 
 
248 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  64.47 
 
 
248 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  63.27 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  64.91 
 
 
248 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.52 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.11 
 
 
255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  61.8 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  62.8 
 
 
250 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  66.37 
 
 
248 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  61.07 
 
 
247 aa  299  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  61.63 
 
 
247 aa  298  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  62.14 
 
 
278 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  60.82 
 
 
257 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  63.41 
 
 
248 aa  288  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  62.04 
 
 
333 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  61.07 
 
 
252 aa  271  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  57.21 
 
 
247 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 
249 aa  268  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  53.25 
 
 
247 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  59.59 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 
248 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 
270 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 
270 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 
248 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 
250 aa  264  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 
270 aa  264  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  52.63 
 
 
248 aa  263  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  54.07 
 
 
247 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
248 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  56.22 
 
 
250 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  53.04 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
270 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 
248 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  53.44 
 
 
249 aa  260  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  53.81 
 
 
436 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
250 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  53.66 
 
 
251 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 
248 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
250 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  55.16 
 
 
248 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  53.41 
 
 
267 aa  258  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  51.63 
 
 
247 aa  258  8e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 
248 aa  257  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 
250 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  52.7 
 
 
247 aa  256  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  49.16 
 
 
244 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  54.5 
 
 
250 aa  255  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.81 
 
 
250 aa  255  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  52.44 
 
 
282 aa  255  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  54.5 
 
 
250 aa  255  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  54.05 
 
 
250 aa  255  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  53.04 
 
 
248 aa  255  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  50.79 
 
 
306 aa  255  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  53.2 
 
 
251 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 
247 aa  254  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  53.2 
 
 
251 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.67 
 
 
237 aa  254  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  53.04 
 
 
248 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>