More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4605 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  75.51 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  71.66 
 
 		 248 aa  364  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  72.76 
 
 		 249 aa  362  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  71.84 
 
 		 247 aa  360  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  75.1 
 
 		 250 aa  358  6e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  73.88 
 
 		 247 aa  352  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  68.98 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  71.14 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  70.73 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  70.33 
 
 		 251 aa  343  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  71.54 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  71.02 
 
 		 247 aa  342  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  70.16 
 
 		 250 aa  339  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  71.02 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  68.83 
 
 		 252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  71.12 
 
 		 249 aa  334  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  71.12 
 
 		 250 aa  334  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  70.61 
 
 		 251 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  69.11 
 
 		 248 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  74.8 
 
 		 248 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  67.76 
 
 		 248 aa  331  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  70.2 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  70.73 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  66.4 
 
 		 249 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  69.64 
 
 		 248 aa  329  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  70.13 
 
 		 248 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  70.13 
 
 		 248 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  69.7 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  68.83 
 
 		 250 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  69.11 
 
 		 333 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  65.99 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  68.55 
 
 		 252 aa  315  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  70.33 
 
 		 245 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  65.71 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  68.57 
 
 		 278 aa  309  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  64.08 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.82 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  60.82 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  57.96 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  58.9 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  53.25 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  55.1 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 		 270 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 		 270 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  54.29 
 
 		 248 aa  261  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  53.33 
 
 		 282 aa  258  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  51.01 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  55.06 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  57.99 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.12 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  57.53 
 
 		 247 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  53.47 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  56.62 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  56.62 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  56.62 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  57.53 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  56.62 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.62 
 
 		 436 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  53.47 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.85 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  55.25 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  56.62 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  55.71 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  55.25 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  55.25 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  56.16 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.14 
 
 		 237 aa  248  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  50.61 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  55.25 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  54.79 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.29 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  55.3 
 
 		 228 aa  245  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  54.55 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>