More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  77.12 
 
 		 252 aa  381  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  76.31 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  72.76 
 
 		 248 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  73.47 
 
 		 247 aa  361  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  71.95 
 
 		 248 aa  360  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  70.8 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  73.66 
 
 		 249 aa  360  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  72.06 
 
 		 248 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  72.69 
 
 		 248 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  74.78 
 
 		 250 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  73.98 
 
 		 248 aa  352  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  73.77 
 
 		 258 aa  348  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  73.06 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0573  phosphoglycerate mutase 1 family  72.47 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0554229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  72.87 
 
 		 248 aa  344  8.999999999999999e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  72.95 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  68.85 
 
 		 247 aa  341  5.999999999999999e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  71.74 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  70.61 
 
 		 247 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  70.12 
 
 		 249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  71.84 
 
 		 247 aa  337  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  72.17 
 
 		 248 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  72.17 
 
 		 248 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  71.84 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  72.36 
 
 		 247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  71.3 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  68.98 
 
 		 248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  68.7 
 
 		 246 aa  326  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  63.56 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  69.57 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  71.54 
 
 		 248 aa  322  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  62.75 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  70.33 
 
 		 257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  69.8 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  64.9 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  65.85 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  67.08 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  67.48 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  57.32 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  59.11 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  59.73 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  57.38 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  56.73 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  57.38 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.56 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  52.96 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  60.36 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  58.18 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  59.01 
 
 		 250 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  59.46 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  57.59 
 
 		 270 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  55.28 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  57.33 
 
 		 436 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  57.59 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  57.59 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  59.01 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  58.64 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  59.01 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  56.97 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.21 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  51.39 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 248 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  57.66 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.04 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4520  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.25 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  54.91 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  51.02 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>